Le son de « pain » s'écrit d'au moins onze façons

in, im, ain, aim, ein, eim, yn, ym, en, un, um : onze façons d'écrire le même son. Chaque graphie garde la trace du mot d'origine : « pain » vient du latin panis, « plein » de plenus, « faim » de fames, « thym » du grec thymon. Ce n'est pas une méchanceté du français : l'orthographe est une machine à remonter le temps.

D'où ça vient

Académie française — graphies concurrentes du son nasal /ɛ̃/
CNRTL — Trésor de la langue française (étymologie) — étymologies citées : pain < panis, plein < plenus, faim < fames, thym < thymum, du grec thymon

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